整编后的南京军区司令部在南京，节制直隶省，总司令为徐孚远中将，兼领禁军军长一职。然后下辖大明帝国陆军第一军，驻扎凤阳府，军长为金运虎；第二军驻扎徐州，军长为夏允彝；第三军驻扎淮安、扬州，军长为史德威；第四军驻扎滁州、和州、泸州，军长为黄得功。

第一军到第四军的驻扎地就是原来的江北四镇，主要任务就是防备北方李自成的大顺军南下。

然后第五军、第六军就分散驻守直隶省其他州府如安庆府、宁国府、常州府、苏州府等地。

武昌军区司令部在湖广省首府武昌，节制湖广省、江西省，总司令为何腾蛟中将、副总司令为袁继咸少将。下辖大明陆军第七军驻扎武昌，第八军驻扎襄阳，第九军驻扎荆州。这三个军也是主要防备北方的。

第十军驻扎常德，防备西部四川的张献忠。第十一军驻扎江西南昌、九江，防守江西全省。

西南军区司令部在贵州省首府贵阳，节制贵州、云南、四川三省，总司令为解学龙少将。下辖陆军第十二军驻扎贵阳，第十三军驻扎四川播州，第十四军驻扎云南昆明。

广州军区司令部在广东省首府广州，节制广东、广西两省，总司令为张同敞少将。下辖陆军第十五军驻扎广州，第十六军驻扎广西桂林。

福州军区司令部在福建省首府福州，节制浙江、福建两省，总司令为郑成功少将。下辖陆军第十七军驻扎浙江杭州，第十八军驻扎福建福州。

然后，郑成功将他老子留下的二十多万官商混合部队，遣散了老弱妇孺，挑出真正的战舰和海军士兵，组成1000多艘战舰、十万人规模的大明帝国东海舰队。

剩下的武装商船和数万水手，则和中央户部、工部组成大明远洋贸易集团，展开大宗货物的远洋贸易。

这个大明远洋贸易集团，中央朝廷占51的股份，郑氏家族占49的股份，由朝廷任命官员进行日常管理，郑氏家族派遣代表进行监督。

由此，杨毅就将郑氏家族的商业分离了出来。以后，郑成功就在杨毅的指示下，专注于海军战舰和武器的升级换代、海军官兵的作战训练，以备将来的海战。

概括起来，全军军事改革后的大明军队，陆军总共19个军，42万人；海军东海舰队1000多艘战舰、10万海军。

全军改革完成后，南京兵工厂开足马力，经过一年多的生产，也存够了足够装备全军的步枪、大炮等先进火器。

对禁军率先使用的这些先进武器，各大军区高级将领都曾亲眼见识过，早已眼馋不已。

因此，杨毅一声令下，各大军区总司令就带着后勤部队蜂拥而至，将各自的武器运回驻地，开始了步枪、大炮的训练。

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